Berikut cabang lomba STQ Nasional 2021 di Maluku Utara:
A. Cabang Seni Baca Alquran
1. Golongan Anak-anak (Putra dan Putri),
2. Golongan Dewasa (Putra dan Putri),
B. Cabang Hafalan Alquran
1. Golongan 1 Juz dan Tilawah (Putra dan Putri),
2. Golongan 5 Juz dan Tilawah (Putra dan Putri),
3. Golongan 10 Juz (Putra dan Putri),
4. Golongan 20 Juz (Putra dan Putri),
5. Golongan 30 Juz (Putra dan Putri),
C. Cabang Tafsir Alquran
Golongan Tafsir Bahasa Arab (Putra dan Putri),
D. Cabang Musabaqah Al-Hadis
1. Golongan Hafalan 100 Hadits dengan Sanad (Putra dan Putri),
2. Golongan Hafalan 500 Hadits tanpa Sanad (Putra dan Putri).